生物資料庫 (Biological Databases) »

miRTarBase

收集實驗驗證的微小核醣核酸與目標基因間作用關係之資料庫。 (Nucl Acids Res, 2011) more . . .

dbPTM

關於蛋白質後轉譯修飾位點特異性與功能相關性的資料庫。 (Nucl Acids Res, 2013) more . . .

RegPhos

探討人體磷酸化蛋白質激酶-基質的網絡。 (Nucl Acids Res, 2011) more . . .

pseudoMap

辨識人體內轉錄假基因中的微小干擾核醣核酸調和機制。 (Database (Oxford). 2013) more . . .


新世代高通量定序分析工具 (Tools for Next Gen. Sequencing) »

miRExpress

分析微小核醣核酸表現的高通量資料。 (BMC Bioinformatics, 2009) more . . .

miRTarCLIP

利用 CLIP 高通量定序和 PAR-CLIP 高通量定序資料分析來標定微小核醣核酸與目標基因間作用關係。 (BMC Genomics, 2013) more . . .


非編碼RNA (MicroRNAs and small RNAs) »

miRTarBase

收集實驗驗證的微小核醣核酸與目標基因間作用關係之資料庫。 (Nucl Acids Res, 2011) more . . .

miRTar

標定微小核醣核酸與目標基因間作用關係之整合性工具 (BMC Bioinformatics, 2011) more . . .

miRStart

人類 miRNA 啟動子資料庫. (Nucl Acids Res, 2011) more . . .

miRExpress

微小核醣核酸高通量定序資料分析工具。 (BMC Bioinformatics, 2009) more . . .

miRTarCLIP

利用 CLIP 高通量定序和 PAR-CLIP 高通量定序資料分析來標定微小核醣核酸與目標基因間作用關係。 (BMC Genomics, 2013) more . . .

RNALogo

良好地呈現結構性核醣核酸模體之特性。 (Nucl Acids Res, 2008) more . . .

sRNAMap

微生物微小非編碼調控核醣核酸資料庫。 (Nucl Acids Res, 2009) more . . .

RegRNA

用來找出調控性 RNA 扮演的角色以及功能性 RNA motif 的強化計算平台。 (Nucl Acids Res, 2006, BMC bioinformatics, 2013) more . . .

RiboSW

根據 RNA 結構及保留的功能性序列發展出的 riboswitches 計算鑑別法。 (RNA, 2009) more . . .

ViTa

病毒上的 microRNA 標的資料庫。 (Nucl Acids Res, 2007) more . . .

miRNAMap

後生動物基因體裡的 microRNA 地圖。 (Nucl Acids Res, 2006, Nucl Acids Res, 2008) more . . .

RNAMST

高效率且靈活辨認結構性同源 RNA 的方法。 (Nucl Acids Res, 2006) more . . .


蛋白質後轉譯修飾 (Protein Post-translational Modifications) »

dbPTM

關於蛋白質後轉譯修飾位點特異性與功能相關性的資料庫。 (Nucl Acids Res, 2013) more . . .

RegPhos

探討人體磷酸化蛋白質激酶-基質的網絡。 (Nucl Acids Res, 2011) more . . .

KinasePhos

辨認蛋白質上特定蛋白激酶磷酸化點位的網路工具。 (Nucl Acids Res, 2005, J. Comp. Chem. 2005) more . . .

KinasePhos (ver. 2)

一個以序列及耦合的模式來辨認蛋白質上的激酶磷酸化位置的網站。 (Nucl Acids Res, 2007) more . . .

Sulfosite

透過整合向量支持機以辨認蛋白質上的酪氨酸硫酸化位置。 (J Comput Chem. 2009) more . . .

MASA

透過整合結構特徵以辨認蛋白質甲基化的位置。 (J Comput Chem. 2009) more . . .

N-ACE

以溶劑可溶性和物理化學性質來辨認蛋白質上的N端乙醯化位置。 (J Comput Chem. 2010) more . . .

dbSNO

一個有關半胱氨酸上的硫基亞硝酸化的資料庫。 (Bioinformatics. 2012) more . . .

SNOSite

利用最大依賴分解度來辨認半胱氨酸上的硫基亞硝酸化與基質位置特異性。 (PLoS One. 2011) more . . .


基因調控與後轉錄調控 (Gene Regulation and Post-transcriptional Regulation) »

PlantPAN

植物啟動子分析工具。 (BMC Genomics, 2009) more . . .

SpliceInfo

人類基因體選擇性剪接模式資料庫 (Nucl Acids Res, 2005) more . . .

ProSplicer

人類基因體選擇性剪接資料庫。 (Genome Biology, 2003) more . . .


合成生物及系統生物學 (Resources for Synthetic Biology and Systems Biology) »

FMM

生物體代謝路徑的重建及比較分析工具。 (Nucl Acids Res, 2009) more . . .

RegPhos

探討人體磷酸化蛋白質激酶-基質的網絡。 (Nucl Acids Res, 2011) more . . .

sRNAMap

微生物微小非編碼調控核醣核酸資料庫。(Nucl Acids Res, 2009) more . . .

ProKware

一個整合性工具展示蛋白質性質於蛋白質三級結構中。 (Nucl Acids Res, 2006) more . . .